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domingo, fevereiro 23, 2025

Página da internet Decair e periódicos: Como um “ESI” interativo de 2006 foi resgatado.


Em 2006 (CITE) 10.1021/ic0519988 (/cite), publicamos um artigo ilustrando vários tipos de pseudorotações em pequenas moléculas. Tem sido citado 20 vezes desde então, um interesse razoável! Descrevemos rotações conhecidas como alavanca e catraca, bem como o modo Berry mais conhecido. Como as diferenças entre essas rotações são bastante sutis, incluímos uma informação de suporte eletrônica interativa para ilustrá -las. Que o ESI foi escrito em HTML e usou o JMOL para animar as rotações. Agora, 16 anos é muito tempo no ecossistema da internet (alguns sugeridos pela WAG anteriores, como cães, que um ano em tempo regular se aproxima de cerca de 7 anos no tempo da internet) e inevitavelmente, como por exemplo, ambos Rasmol (citação) 10.1039/p29950000007 ( /cite) e carrilhão antes dele, o JMOL não funciona mais quando invocado de um navegador da internet; Java Applets está muito morto e agora estamos na quarta geração do visualizador de moléculas, JSMOL. Dois dias atrás, fui contactado por alguém (obrigado Peter!), Que notou que a página de destino do diário não parecia apontar para nenhum ESI. Aqui eu conto a história do que aconteceu a seguir.

Assim, a página de destino (citação) 10.1021/ic0519988 (/cite) não menciona nenhum método para acessar nenhum ESI. Mas como a página é paga, você precisa fazer login para ver mais. Quando você faz isso, você recebe uma referência a “objetos aprimorados”, para que eu deve explicar o que eram.

Atualmente, a norma parece ser que o ESI é expresso como um arquivo PDF, mas isso permite interatividade apenas com extrema dificuldade. Em 2006, se você quisesse esse recurso, você usou HTML. O editor (ACS) cunhou a expressão do WEO, ou objeto aprimorado da Net. Produzimos talvez 50 ou mais para vários editores e naqueles dias eles estavam hospedados nos websites dos próprios editores. Em algum momento, desde 2006, essas páginas foram movidas e o objeto aprimorado para este artigo foi (temporariamente?) “Perdido”. Talvez seja fácil entender por que, uma vez que as mudanças nos fluxos de trabalho da publicação dos editores precisariam levar em consideração essas páginas e provavelmente não havia o suficiente para merecer a inclusão no fluxo de trabalho.

Então, em 2022, quando fui contactado por Peter sobre esse assunto. Sempre que submetemos esse ESI interativo, sempre mantivemos uma cópia native e, de fato, isso estava rapidamente localizado na DOI: 10.14469/hpc/10849agora é claro que alocou seu próprio doi. A essa altura, o ESI havia perdido sua interatividade, mas mais preocupante, estava sem mensagens de erro. Por que? Este foi o código HTML usado:


 
 
 
 
 
 
 
 

Nos navegadores da internet modernos, isso é simplesmente ignorado. Portanto, a solução é reescrever esse código na sintaxe moderna e, para isso, voltei -me a um herói e especialista de longa information, Angel, que é um dos mantenedores ativos do JSMOL, o sucessor do JMOL. Algumas horas depois, um roteiro de conversão voltou. Tem apenas 55 linhas de comprimento! Ele é invocado no cabeçalho do documento HTML como:



E ei Presto, tudo funciona como originalmente. Transclude um pequeno trecho aqui para dar um sabor, embora o authentic seja formatado para páginas largas, então vá ver todo o ESI lá.

Então, qual é a mensagem de levar para casa? Bem, acontece que a sintaxe Java/JMOL desenvolvida para a Net há mais de 20 anos se mostrou bastante resiliente. E assim, as páginas em que a tecnologia os ultrapassam às vezes podem ser facilmente resgatadas e restauradas de volta à vida. Vários desses weos dos primeiros naiços foram de fato resgatados por expedientes, como descrito acima. E talvez em 10 anos quando JavaScript e JSMOL se mudaram, serão necessários mais resgates. Mas se eu tivesse sido perguntada em 2006 ou anteriormente se esperava que essas páginas interativas de ESI ainda estivessem trabalhando 16 anos depois, posso ter respondido que parecia improvável. Portanto, é uma surpresa muito agradável descobrir que eles (agora) são. Tudo o que precisamos é para o próprio diário apontar para uma versão em funcionamento; Para isso, mantenha os olhos abertos.

Em um ponto mais geral, uma história de “ESI” usada na química seria um tópico interessante. Embora geralmente pensasse como tendo suas raízes por volta de 1996, pode muito bem voltar mais. Algum historiador por perto?


Disponível em https://wiki.jmol.org/index.php/jmol_javascript_object/legacy e 10.14469/hpc/10852


Esta entrada foi publicada na sexta -feira, 12 de agosto de 2022 às 8:33 e é arquivada sob não categorizada. Você pode seguir qualquer resistência a esta entrada através do RSS 2.0 alimentar. Você pode Deixe uma respostaou trackback do seu próprio web site.

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