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quarta-feira, abril 16, 2025

Conjuntos de dados harmonizados de análises microbiológicas de uma pesquisa francesa de monitoramento de solo em escala nacional


Os solos suportam muitos serviços ecossistêmicos (por exemplo, fertilidade, armazenamento de carbono ou decomposição de resíduos). Todos estes serviços são suportados principalmente pelo enorme reservatório de biodiversidade microbiana do solo. No entanto, a microbiota do solo está constantemente sujeita a diversas estresses naturais e/ou antropogênicos (por exemplo, desflorestação, intensificação da utilização dos solos e aquecimento world). Estas perturbações têm uma influência significativa nestas comunidades microbianas do solo e levam a um impacto world sobre funções do solo. Nos últimos 15 anos, o Rede Francesa de Monitoramento da Qualidade do Solo (RMQS) tem cumprido estes objetivos de avaliação e monitorização a longo prazo da qualidade do solo em França.

O RMQS é baseado no monitoramento de 2.240 websitesEstá distribuído por todo o território francês ao longo de uma grelha quadrada sistemática de células de 16 km x 16 km, para ser representativo dos diferentes tipos de solos e dos seus usos do solo. A amostragem, caracterização e observações do solo são feitas a cada 15 anos no centro de cada célula. O RMQS é provavelmente um dos estratégia de amostragem mais intensiva e extensa à escala nacional na Europa.

Graças ao uso de várias ferramentas moleculares, foi produzido um corpo substancial de conhecimento científico sobre a microbiota do solo da RMQS.

Visão geral esquemática dos conjuntos de dados microbianos RMQS1.

Curiosamente, cada conjunto de dados produzido (por exemplo, medidas de abundância dos genes 16S e 18S, a proporção F:B ou os dados de diversidade) exibiu padrões biogeográficos diferentes e específicos comparados entre si tomados separadamente, refletindo cada um um instantâneo complementar das comunidades microbianas do solo. Para melhorar a reutilização desses conjuntos de dados, harmonizamos e reorganizamos todos os dados microbiológicos disponíveis em um Coleta de dadoscom foco na ligação de conjuntos de dados com outros Parâmetros ambientais do RMQS mais facilmente.

Esta coleção fornecerá informações sobre o ecologia de comunidades microbianas em um escala territorial e descrever os diferentes grupos microbianos observados em solos franceses, suas distribuição espacialdeles requisitos ecológicos e seus interações. No geral, esta coleção ajudará os pesquisadores a compreender melhor a organização e a dinâmica das comunidades microbianas do solo em todo o espaço em escala nacional.

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