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sexta-feira, abril 4, 2025

Como os dados devem ser citados em artigos de periódicos? Um pedido Crossref para comentário público!


Metadados são algo que acontece nos bastidores e raramente preocupam o autor ou os leitores de artigos científicos. Aqui conto uma história onde tem uma exposição bastante maior. Para periódicos de ciências e química, cada artigo publicado possui um registro de metadados correspondente, associado ao identificador persistente do artigo e conhecido pela maioria como seu DOI. Os metadados contêm informações sobre o artigo, como seus autores e afiliações, o título do artigo e seu resumo, e são submetidos/registrados na Crossref – uma organização criada em 1999 em nome de editoras, bibliotecas, instituições de pesquisa e financiadores. . Adições relativamente recentes aos metadados do Crossref são as citações incluídas no artigo, chamadas Citações abertas. Isso ajudou a criar a nova área de métricas de artigos, usada, por exemplo, Altmetria ou Dimensões para ajudar a identificar os impactos que as publicações científicas têm. Basicamente, se um artigo é citado por outro, está causando impacto. Muitas citações de um determinado artigo por outros artigos significam um impacto maior. A maioria dos investigadores adora ter um impacto elevado – e, claro, positivo – e, talvez para o bem ou para o mal, as carreiras académicas dependem, em certa medida, de tais impactos.

Com isso como pano de fundo, passo agora para um artigo nosso recente.(cite)10.1039/D3DD00246B(/cite) O registro de metadados deste artigo pode ser obtido usando a consulta:
https://api.crossref.org/works/10.1039/D3DD00246B/rework/software/vnd.crossref.unixsd+xml (recuperado em 14/07/2024).

Possui 63 citações no corpo do artigo, com o aspecto incomum, mas pertinente, de que 30 delas não se referem a outros artigos ou a hyperlinks da internet, mas a dados – especificamente dados FAIR. Até comentamos isso nas nossas conclusões – “As citações aqui anotadas estão incluídas no registro de metadados do artigo, que está registrado no Crossref, embora com uma limitação atual significativa: não há atualmente nenhuma declaração formal dessas citações como indicadores específicos para uma coleta de dados FAIR.” Esta afirmação foi feita com base na premissa de que as citações dos artigos mostrariam uma correspondência de 1:1 com as entradas de metadados (o que acontece, veja abaixo. Mas veja também aqui(citar)10.48550/arXiv.2310.02192(/citar)).

Antes de dar uma olhada nisso, observo que os metadados CrossRef não tratam todas as citações igualmente. A forma tradicional de citação aparece como tal para a referência 25 (são 29 no complete).


J. Chem. Phys.
Scalmani
2010
114110
10.1063/1.3359469

Uma variação disso é usada para variações em artigos de periódicos, como preprints, onde um componente “não estruturado” é adicionado à citação. Geralmente é usado como um breve comentário adicionado pelos autores em relação à citação – neste caso indicando que se refere a uma pré-impressão do próprio artigo. O termo “não estruturado” também significa que o comentário pode não ter quaisquer padrões previsíveis, ou usar quaisquer termos de um dicionário específico, e pode necessitar da experiência especial de um ser humano para processá-lo. Em outras palavras, componentes “não estruturados” podem não ser “amigáveis ​​à máquina”. Ou que uma máquina pode ter que trabalhar muito para descobrir o que fazer com o comentário.


ChemRxiv
Braddock
2024
10.26434/chemrxiv-2023-vcmcl
For a preprint, see, D. C.Braddock, S.Lee and H. S.Rzepa, SWERN Oxidation. 
transition construction Principle is OK, ChemRxiv, 2023, preprint, 10.26434/chemrxiv-2023-vcmcl


Uma terceira variação está presente, mas desta vez aparentemente relacionada aos próprios dados. Observe novamente o uso de um comentário “não estruturado”, que efetivamente acrescenta a informação que a citação pode “aparentemente” estar relacionada aos dados. Para ser justo, o título do quantity também faz isso, mas essa não deveria ser a sua função!


Imperial School Analysis Information Repository
Braddock
2023
10.14469/hpc/13108

D. C.Braddock , H. S.Rzepa and S.Lee, Imperial School Analysis Information Repository, 2023, 
10.14469/hpc/13108

Por que isso pode ser importante? Bem, o mantra hoje em dia é que a informação tem de ser processável não só por humanos, mas também por máquinas que realizam aprendizagem ou “inteligência synthetic”. Tal ML/IA trata, pelo menos em parte, de encontrar padrões previsíveis em dados, e citações não estruturadas implicam uma certa falta de previsibilidade! Uma máquina pode “ler” um artigo de periódico e isso também deve ser possível para os dados sobre os quais são feitas as inferências relatadas no artigo. Portanto, esses dados têm de ser acessíveis em primeira instância e depois interoperáveis ​​e reutilizáveis ​​em segunda instância. Esses atributos são conhecidos como FAIR. Portanto, seria ótimo se os metadados do artigo pudessem indicar a uma máquina quando os dados associados poderiam estar disponíveis – e melhor ainda, sugerir que esses dados poderiam ter atributos de FAIR.

Portanto, agora entendemos que é necessário haver uma forma formal e acordada de expressar especificamente uma citação de dados nos metadados CrossRef, em vez de apenas conter um comentário não estruturado na citação. A boa notícia é que isso está a caminho! UM documento de discussão pública solicita comentários até 15 de agosto de 2024 e apresenta duas novas adições Crossref aos metadados, que são interpretadas abaixo em termos do artigo que estamos discutindo.

  1. sort=”dataset” key="D3DD00246B/cit19/1">
    Imperial School Analysis Information Repository
    Braddock
    2023
    10.14469/hpc/13108
    

Uma declaração mais formal também foi adicionada agora, e cito as razões do Crossref para sua inclusão “gostaríamos de oferecer suporte a vários tipos de instruções de texto livre em nossos registros de metadados, pois recebemos comentários de que elas podem ser úteis para usuários de metadados downstream que são capazes de analisar e refinar trechos de texto de maneiras que podem ser úteis. As declarações também são úteis para reutilização em algumas situações.” De certa forma, substitui a citação não estruturada do exemplo acima, mas agora usando um termo de dicionário controlado para se relacionar especificamente com dados.

  1. sort=”knowledge availability”>Information Availability and Discovery Assertion

Vejamos agora como tudo isso é tratado no artigo que estamos discutindo.(cite)10.1039/D3DD00246B(/cite)

  • Os dados em si, encontrados como uma coleção com seu próprio registro de metadados(cite)10.14469/hpc/13058(/cite) podem e fazem citar o artigo(citar)10.1039/D3DD00246B(/citar).
  • O registro de metadados Crossref para o artigo em 17.07.2024 tem 38 entradas que incluem um incluindo 30 relativos a dados (que atualmente são inferidos por um ser humano).
  • Se as alterações nos metadados mencionadas acima forem implementadas, as 30 citações dos dados serão claramente identificadas como tal, como no exemplo mostrado no merchandise 1 acima, e nenhuma inferência humana será necessária.

O CrossRef documento de discussão pública permanecerá disponível por mais quatro semanas ou mais – enquanto isso, são solicitados comentários públicos! Uma vez implementadas essas melhorias, esperamos que o registro de metadados do artigo que estamos analisando aqui possa, por sua vez, ser atualizado para refletir a riqueza de dados FAIR do artigo. E então talvez Altmetria ou Dimensões pode começar a produzir métricas relacionadas ao impacto dos dados citados. Observe este espaço!


Uma diferença entre o artigo em si e o seu registo de metadados é que o primeiro não muda {a menos que seja emitida uma corrigenda} – é o chamado Versão do registro ou VORenquanto o próprio registro de metadados pode ser atualizado de forma responsável quando considerado necessário. Portanto, é importante observar an information associada a qualquer versão de um registro de metadados.

Esta entrada foi publicada quinta-feira, 18 de julho de 2024 às 8h02 e arquivada em Química interessante. Você pode acompanhar quaisquer respostas a esta entrada através do RSS 2.0 alimentar. Você pode deixe uma respostaou trackback do seu próprio website.

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